
	Institut de Biologie et de Chimie des Protéines UMR 5086 CNRS/Université Lyon 7, passage du Vercors 69367 Lyon cedex 7 FRANCE Site Web : www.ibcp.fr Téléphone : +33(0)4-37-65-29-44 Contact :

Krystyna ZAKRZEWSKA
Equipe Publications de l'équipe DR-CNRS

1. A systematic molecular dynamics study of nearest-neighbor effects on base pair and base pair step conformations and fluctuations in B-DNA.

Lavery R, Zakrzewska K, Beveridge D, Bishop TC, Case DA, Cheatham T, Dixit S, Jayaram B, Lankas F, Laughton C, Maddocks JH, Michon A, Osman R, Orozco M, Perez A, Singh T, Spackova N, Sponer J
(2010) Nucleic Acids Res 38 : 299-313

2. Conformational analysis of nucleic acids revisited: Curves+.

Lavery R, Moakher M, Maddocks JH, Petkeviciute D, Zakrzewska K
(2009) Nucleic Acids Res 37 : 5917-29

3. Local and global effects of strong DNA bending induced during molecular dynamics simulations.

Curuksu J, Zacharias M, Lavery R, Zakrzewska K
(2009) Nucleic Acids Res 37 : 3766-73

4. Protein-DNA binding specificity: a grid-enabled computational approach applied to single and multiple protein assemblies.

Zakrzewska K, Bouvier B, Michon A, Blanchet C, Lavery R
(2009) Phys Chem Chem Phys 11 : 10712-21

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